Коллекции музея

Насчитывает более 33000 ед. хр. основного фонда. В ее состав входят бронзовые, железные, костяные предметы, изделия из камня, керамические сосуды, а также изваяния, стелы и плиты с рисунками и руническими надписями. Музей хранит самое уникальное собрание древнейшей бронзы (около 30 тыс.ед.).
Насчитывает более 30 тыс. ед. хр. Хронологически коллекция охватывает период XIX-нач. XXI вв. Это документы, печатные издания, карты регионов Сибири и России и др.
Насчитывает 46512 ед. хр. основного фонда. Она включает зоологические, ботанические материалы, а также предметы палеонтологии, антропологии, геологии.
Насчитывают более 600 ед. хр. основного фонда. В коллекцию входят работы известных художников: К.Луканина, В.Тирона, Ф.Кушнарева, работы А. Поппа, в т.ч. портрет Н.Е. Мартьянова, внука основателя Минусинского музея Н.М. Мартьянова.
В 2011 г. из коллекции изделий прикладного искусства, быта и этнографии выделен фонд «Техника»: бытовая техника и бытовые приборы, раритетные радиоприемники и телевизоры.
Насчитывает более 90 ед. хр. основного фонда. В разделе огнестрельного оружия имеются пистонные ружья перв. пол. XIX в., изготовленные на заказ, охотничьи ружья с гравировкой золотом, пистолеты с кремневыми замками нач. XIX в., дорожные пистолеты XIX в. трех- и четырехствольные, которыми пользовались партизаны во время Гражданской войны в Сибири, а также гангстерский револьвер сер. XIX в. с рукоятью в виде кастета.
Насчитывает 17104 ед. основного фонда. Это предметы культуры и быта народов Южной Сибири и Азии и др.
Насчитывает более 30 ед. хр. основного фонда. В данном фонде хранится несколько скульптурных работ заслуженного художника РСФСР Г.Д. Лаврова, автора памятников В.И. Ленину, П.Е. Щетинкину и бюстов Н.М. Мартьянова, В.И. Сурикова.
Насчитывают более 8000 ед.хр. основного фонда. В составе собрания монеты России и иностранных государств, советские ордена, медали, знаки и значки, бумажные денежные знаки России и иностранных государств.
Насчитывает более 128 тыс. ед. хр. В собрании научной библиотеки музея находятся издания по истории Сибири и России - географии, этнографии, археологии, естествознанию, справочная литература и др.
Насчитывают 740 ед. хр. основного фонда. В собрании имеются иконы (более 30 ед.), написанные на дереве, холсте, иконы литьё конца ХУШ – Х1Х вв.. Уникальными являются – портрет Иннокентия Иркутского, икона «Поругание Христа» Мартына Хозяинова и др.